Восемнадцать лет преподавал в Киево-Могилянской академии, был приглашенным профессором Гарварда и Грайфсвальда, с 2017 по 2025 год вел украинскую программу Института Кеннана в Вашингтоне. Основатель журнала Ideology and Politics.

Двадцать восемь лет в Институте востоковедения РАН, с 1999 года консультант Института перевода Библии. Перевел с древнегреческого весь Новый Завет, с древнееврейского — книги Иова и Притчей. Автор «Введения в библейскую экзегетику».

С 1999 года в Праге, с 2023 года главный редактор Русской службы Радио Свобода. Автор книг «Австро-Венгрия: судьба империи» и «Меч Христов. Карл I Анжуйский и становление Запада».

Девять лет преподавал в Высшей школе экономики и Шанинке, с 2022 года исследователь Принстонского университета, сейчас работает в университете Майнца. Автор книг «Война в XXI веке» и «Война, или В плену насилия».

Защитил диссертацию по истории практик заботы о себе. Преподавал философию и богословские дисциплины в Свято-Тихоновском гуманитарном университете и Ростовском педагогическом университете. Автор книг «Эпоха выгорающих супергероев» и «Критика психополитического разума».

Занимался феноменологией Гуссерля и Шпета, затем текстами древнего Ближнего Востока: масоретской Библией, шумерскими лексическими списками. Автор монографии «Язык и мышление в трансцендентальной феноменологии» и курсов по теологии кино.

Перевел «Медитации» Декарта с латыни. Автор книг «Фома Аквинский: введение в мышление» и «Философия права». С сентября 2024 года проводит занятия и руководит «Школой философии Андрея Баумейстера».

Тридцать лет в Институте истории Украины, где заведует сектором исследований Киевской Руси; преподавал в Украинском научном институте Гарвардского университета. Автор книг «Очерки начальной Руси» и «Киевская Русь и Малороссия в XIX веке».

Сорок с лишним лет в Институте философии НАН Украины, около двадцати — на кафедре философии Киево-Могилянской академии. Автор учебника «Этика: курс лекций», выдержавшего пять изданий, и книг «Уязвимость любви» и «Право быть собой».